Цитата: если агент перечислил другой организации % принципала, то будет ли та организация платить с них налог?
Возможно да, возможно нет. Это напрямую зависит от условий сделки между принципалом и третьей стороной, в рамках которой они (между собой) и договорились о таком перечислении.
Например, третья сторона могла заключить с принципалом договор о предоставлении каких-то услуг и принципал решил сэкономить день-другой плюс банковскую комиссию за перевод, попросив своего должника (агента) перечислить денежные средства не на свои реквизиты, а напрямую - на счёт поставщика нужных ему услуг. И тогда, безусловно, у третьей стороны возникает налоговая база (в виде полученного аванса либо расчёта за уже оказанные услуги). А принципал в этот момент признает в своей налоговой базе не только доход в виде выручки, полученной от агента, но и расход - в размере оплаты полученных услуг.
А вот если, допустим, у принципала заключён с третьей стороной договор займа, тогда дохода у получателя средств не возникает. Как и расхода у принципала.
Поэтому, при перечислении оплаты по письму, важным бывает указать в назначении платежа реквизиты сразу двух договоров: как между плательщиком и его кредитором, так и между кредитором и третьей стороной, на чей банковский счёт направляются деньги. А если вы уже оплатили, но забыли расписать информацию столь подробно, тогда можете от своего имени направить письмо с уточнением назначения платежа в банк и каждой из заинтересованных сторон.